Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC17A7Q9P2U7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC17A7Q9P2U7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC17A7Q9P2U7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC17A7Q9P2U7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms