Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CC2D2AQ9P2K1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CC2D2AQ9P2K1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CC2D2AQ9P2K1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
CC2D2AQ9P2K1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
CC2D2AQ9P2K1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms