Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J5

LARS, Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARSQ9P2J5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LARSQ9P2J5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LARSQ9P2J5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms