Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL20A1Q9P218 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL20A1Q9P218 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL20A1Q9P218 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COL20A1Q9P218 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL20A1Q9P218 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL20A1Q9P218 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms