Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNRD1Q9P1U0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNRD1Q9P1U0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms