Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCKIPSDQ9NZQ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCKIPSDQ9NZQ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms