Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms