Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GGA3Q9NZ52 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GGA3Q9NZ52 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GGA3Q9NZ52 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms