Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VNN3Q9NY84 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VNN3Q9NY84 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms