Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MED29Q9NX70 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED29Q9NX70 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED29Q9NX70 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms