Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RHBDL2Q9NX52 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RHBDL2Q9NX52 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms