Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC28Q9NX36 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC28Q9NX36 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms