Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC6A13Q9NSD5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC6A13Q9NSD5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A13Q9NSD5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241 ms