Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDC42SE2Q9NRR3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDC42SE2Q9NRR3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms