Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCL28Q9NRJ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCL28Q9NRJ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms