Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF3Q9NR81 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGEF3Q9NR81 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF3Q9NR81 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms