Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GDF3Q9NR23 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDF3Q9NR23 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF3Q9NR23 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms