Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS2Q9NR19 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSS2Q9NR19 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSS2Q9NR19 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms