Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ASCL3Q9NQ33 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ASCL3Q9NQ33 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms