Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
VTA1Q9NP79 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VTA1Q9NP79 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms