Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG4Q9H9E3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COG4Q9H9E3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COG4Q9H9E3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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