Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCAS3Q9H6U6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BCAS3Q9H6U6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCAS3Q9H6U6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms