Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms