Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SHARPINQ9H0F6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHARPINQ9H0F6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHARPINQ9H0F6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms