Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LSG1Q9H089 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LSG1Q9H089 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LSG1Q9H089 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LSG1Q9H089 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LSG1Q9H089 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LSG1Q9H089 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
LSG1Q9H089 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LSG1Q9H089 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LSG1Q9H089 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LSG1Q9H089 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LSG1Q9H089 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LSG1Q9H089 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LSG1Q9H089 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LSG1Q9H089 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LSG1Q9H089 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LSG1Q9H089 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LSG1Q9H089 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LSG1Q9H089 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LSG1Q9H089 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LSG1Q9H089 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
LSG1Q9H089 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LSG1Q9H089 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LSG1Q9H089 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LSG1Q9H089 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LSG1Q9H089 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
LSG1Q9H089 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LSG1Q9H089 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LSG1Q9H089 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LSG1Q9H089 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LSG1Q9H089 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LSG1Q9H089 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LSG1Q9H089 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LSG1Q9H089 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LSG1Q9H089 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LSG1Q9H089 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LSG1Q9H089 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
LSG1Q9H089 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LSG1Q9H089 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LSG1Q9H089 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LSG1Q9H089 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LSG1Q9H089 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LSG1Q9H089 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LSG1Q9H089 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LSG1Q9H089 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LSG1Q9H089 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LSG1Q9H089 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LSG1Q9H089 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LSG1Q9H089 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LSG1Q9H089 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LSG1Q9H089 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms