Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCSER1Q9C0I3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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