Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CIPCQ9C0C6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIPCQ9C0C6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms