Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRINP2Q9C0B6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRINP2Q9C0B6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRINP2Q9C0B6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms