Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRCC1Q9C099 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRCC1Q9C099 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRCC1Q9C099 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms