Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM8Q9BZR9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM8Q9BZR9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms