Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM54Q9BYV2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM54Q9BYV2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM54Q9BYV2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms