Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDCA4Q9BXL8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDCA4Q9BXL8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDCA4Q9BXL8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDCA4Q9BXL8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDCA4Q9BXL8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CDCA4Q9BXL8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDCA4Q9BXL8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDCA4Q9BXL8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms