Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX95

SGPP1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP1Q9BX95 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SGPP1Q9BX95 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGPP1Q9BX95 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGPP1Q9BX95 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms