Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JAM3Q9BX67 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms