Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWS9

CHID1, Chitinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1Q9BWS9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHID1Q9BWS9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHID1Q9BWS9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms