Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKNK1Q9BUB5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKNK1Q9BUB5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms