Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HERPUD2Q9BSE4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERPUD2Q9BSE4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms