Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LARP6Q9BRS8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LARP6Q9BRS8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms