Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP7

FDXACB1, Ferredoxin-fold anticodon-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDXACB1Q9BRP7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FDXACB1Q9BRP7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FDXACB1Q9BRP7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms