Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP1

PDCD2L, Programmed cell death protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2LQ9BRP1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCD2LQ9BRP1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCD2LQ9BRP1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCD2LQ9BRP1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCD2LQ9BRP1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCD2LQ9BRP1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCD2LQ9BRP1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCD2LQ9BRP1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCD2LQ9BRP1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCD2LQ9BRP1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCD2LQ9BRP1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCD2LQ9BRP1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCD2LQ9BRP1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms