Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MESP1Q9BRJ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MESP1Q9BRJ9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MESP1Q9BRJ9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms