Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CPPED1Q9BRF8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CPPED1Q9BRF8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms