Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDF15Q99988 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GDF15Q99988 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GDF15Q99988 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms