Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF6BQ99941 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF6BQ99941 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF6BQ99941 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF6BQ99941 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATF6BQ99941 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATF6BQ99941 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATF6BQ99941 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATF6BQ99941 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATF6BQ99941 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATF6BQ99941 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATF6BQ99941 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATF6BQ99941 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms