Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP5SQ99766 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5SQ99766 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms