Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SIGMAR1Q99720 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIGMAR1Q99720 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms