Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHP1Q99653 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHP1Q99653 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms