Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA3Q99618 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDCA3Q99618 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDCA3Q99618 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms