Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KRT12Q99456 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT12Q99456 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms