Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDRT15Q96T59 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDRT15Q96T59 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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